O Museu Didático de Anatomia teve seu início em 1962, por meio da Faculdade Estadual de Odontologia (FEOL), com uma pequena coleção de crânios de animais doados pelo professor Carlos da Costa Branco, que foi o primeiro professor titular de Anatomia da FEOL, e com macroescultura dentária em cera, confeccionada pela primeira turma de Anatomia do curso de Odontologia. Em 09 de outubro de 1997, as professoras Marilinda Vieira dos Santos Costa, Maria Aparecida Vivan de Carvalho e Vilma Schwald Babboni concretizaram um antigo sonho do Departamento, ao dado o nome do primeiro professor de Anatomia ao Museu, que ou a se chamar Museu Professor Carlos da Costa Branco.